La mayor parte del presupuesto de la UE se gestiona conjuntamente con las administraciones nacionales y regionales a través de los Fondos Estructurales y de Inversión. Entre estos fondos figuran el Fondo Social Europeo (FSE) o el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER).

Por otro lado, existen fondos que gestiona directamente la UE. Estos se asignan en forma de:

Programas y Subvenciones para proyectos concretos relacionados con las políticas de la UE. Por norma general se conceden tras la publicación de una "convocatoria de propuestas".

Contratos publicados por las instituciones europeas para la adquisición/prestación/ejecución de bienes, servicios u obras: estudios, formación, organización de conferencias, equipos informáticos, etc.

 Programas y subvenciones para proyectos